北京基因組所揭示RNA甲基化調(diào)控基因剪接機(jī)制

編輯: 逍遙路 關(guān)鍵詞: 高中生物 來(lái)源: 高中學(xué)習(xí)網(wǎng)


YTHDC1調(diào)控mRNA選擇性剪接

中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所精準(zhǔn)基因組醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及遺傳與發(fā)育協(xié)同創(chuàng)新中心楊運(yùn)桂課題組在研究m6A甲基化修飾調(diào)節(jié)mRNA選擇性剪接規(guī)律過(guò)程中,發(fā)現(xiàn)了讀碼器YTHDC1通過(guò)招募前體mRNA剪接因子SRSF3同時(shí)抑制剪接因子SRSF10與RNA的結(jié)合,促進(jìn)外顯子被保留的分子機(jī)制。該研究結(jié)果于2月在MolecularCell雜志在線發(fā)表。

研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)串聯(lián)親和沉淀的方法篩選YTHDC1的互作蛋白,發(fā)現(xiàn)與其相互作用的兩個(gè)mRNA剪接因子SRSF3(SRp20)和SRSF10(SPp30c),結(jié)合轉(zhuǎn)錄組和光交聯(lián)-RNA測(cè)序及生物信息技術(shù),證明YTHDC1和SRSF3傾向于促進(jìn)外顯子保留,但SRSF10則傾向于促進(jìn)外顯子的剪接。YTHDC1通過(guò)促進(jìn)SRSF3,同時(shí)抑制SRSF10的核小斑定位及它們結(jié)合RNA的能力來(lái)調(diào)控mRNA選擇性剪接,而且只有野生型的YTHDC1能夠回補(bǔ)因敲低YTHDC1引起的SRSF3和SRSF10核小斑定位、RNA結(jié)合能力和靶基因mRNA選擇性剪接變化。

結(jié)合研究團(tuán)隊(duì)前期參與發(fā)現(xiàn)的RNA甲基化修飾酶(Jiaetal.NatureChemicalBiologyZhengetal.MolecularCellPingetal.CellResearch)及其甲基化位點(diǎn)選擇性機(jī)制(Chenetal.CellStemCell)和m6A修飾外顯子被保留現(xiàn)象(Zhaoetal.CellResearch),m6A讀碼器YTHDC1調(diào)控mRNA剪接分子機(jī)制的闡明,為進(jìn)一步研究m6A的生物功能和RNA表觀遺傳提供依據(jù),為研究與正常生理(如干細(xì)胞干性維持和分化)或異常病理生命活動(dòng)(如惡性腫瘤等)關(guān)聯(lián)的分子機(jī)理提供新的表觀調(diào)控研究方向。

該項(xiàng)研究得到科技部、國(guó)家自然科學(xué)基金和中科院先導(dǎo)專項(xiàng)等項(xiàng)目的支持。


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